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复旦专家团队探索拓铺嗅神经母细胞瘤份子分型及肿瘤微情况图谱

记者刘轶琳11月22日报导:复旦年夜学附属眼耳鼻喉科病院余洪猛、孙希才团队在国际学术期刊《天然-癌症》(Nature Cancer,中科院、JCR双一区TOP期刊,影响因子23.5)颁发了题为《单细胞转录组学解析嗅神经母细胞瘤亚型及肿瘤异质性》(Single-cell transcriptomic landscape deciphers olfactory neuroblastoma subtypes and intra-tumoral heterogeneity)的研究论文,首次提出了嗅神经母细胞瘤基底型/神经型/间质型“三分型体系”及分类尺度。

复旦专家团队探索拓铺嗅神经母细胞瘤份子分型及肿瘤微情况图谱

嗅神经母细胞瘤(Olfactory Neuroblastoma, ONB)是一种起源于嗅上皮的罕有鼻腔鼻窦恶性肿瘤,年病发率仅约4例/万万。ONB高发生于前颅底嗅区,临床表型常体现为从惰性生长到高度侵袭性的多样生物学举动,其份子机制以及细胞起源今朝尚不明确。

比年来,国际研究者发明ONB可动力自嗅黏膜中的分歧细胞类型,但大都分型研究次要基于bulk RNA-seq数据(通例转录组测序数据),没法对肿瘤内异质性入行深刻探索,已经有的单细胞组学研究还没有对肿瘤亚型及其潜伏的医治靶点入行切确描写。ONB肿瘤微情况(TME)繁杂且异质性显著,入一步增长了诊断以及医治的难度,而今朝大都研究仅限于肿瘤细胞自己,而未周全探究TME中免疫细胞、基质细胞与肿瘤细胞的互相作用。

在这项最新功效中,鼻颅底肿瘤研究团队以高通量单细胞转录组学(scRNA-seq)为次要东西开展深刻研究。依托本中间富集年夜量鼻颅底罕有肿瘤的临床样本上风,研究团队首次提出嗅神经母细胞瘤基底型/神经型/间质型分型体系及分类尺度,并将单细胞阐发效果投射到更年夜样本量的bulk RNA行列步队、临床病例行列步队,对发明效果入行了有用验证。本研究还揭示了嗅神经母细胞瘤肿瘤微情况互作的份子机制,并经由过程罕有肿瘤临床前模子的构建,对基于嗅神经母细胞瘤份子内涵型的精准医治入行了探索。