核酸检测是怎样发现新冠病毒的
时间:2021-08-18 10:20 点击:次
张田勘 在抗击新冠肺炎的进程中,经由过程核酸检测发现病毒传染者,已是年夜家再熟习不外的检测体例。针对今朝残虐全球的德尔塔变异毒株,我国自立研发的检测产物可以或许快速精准辨认。那末,核酸检测为何能发现病毒传染?我们今天就来聊一聊与此有关的科学题目。 所有生物除朊病毒外都含有核酸,核酸包罗脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),新型冠状病毒是一种仅含有RNA的病毒,病毒中特异性RNA序列是辨别该病毒与其它病原体的标记物。 新冠病毒的核酸检测就是要检测病毒的RNA基因组的一些有标记性的基因片断,用核酸检测试剂就可以检测出来。 在新冠疫情产生早期,中国研究职员在极短时候内就完成了对新冠病毒全基因组序列的解析,并经由过程与其他类似病毒,如冠状病毒的基因组序列对照,发现了新冠病毒中的特异核酸序列。是以,若是能在受检者样本中检测到新冠病毒的特异核酸序列,便可以判定这人被传染。 检测新冠病毒特异核酸序列,要先将新冠病毒核酸(RNA)逆转录为DNA,再采取PCR(多聚酶链反映)方式进行放年夜或扩增,以检测特定的基因序列。 PCR的感化是扩增DNA,也就是对选择出的具有特异性的新冠病毒部门怪异的基因片断作为靶标DNA,将其序列进行指数级的扩增。每个扩增出来的DNA序列,都可与预先插手的一段荧光标识表记标帜探针连系,发生荧光旌旗灯号。扩增出来的靶基因越多,累计的荧光旌旗灯号就越强,以此来肯定样本中是不是有病毒核酸,也即确诊受检者是不是被传染。 这类核酸检测手艺的关头,是对病毒特异性DNA片断进行扩增。 1953年,沃森和克里克颁发了DNA双螺旋布局模子,让人们知道了DNA的份子布局,也开启了从份子上理解生命的时期。可是,人体的一个细胞只有一组DNA,既细小,又难以分手和提取来进行体外研究。要进行DNA份子的研究,必需有一种手艺能在体外扩增DNA份子。 1971年,美国麻省理工学院的传授科拉纳等人提出核酸体外扩增的假想,经DNA变性,与适合的引物杂交,用DNA聚合酶延长引物,其实不断反复该进程即可扩增DNA。可是那时手艺程度有限,这一假想难以实现。 1976年,就读于美国俄亥俄州辛辛那提年夜学生物系的中国台湾科学家钱嘉韵,从黄石公园热泉中发现的嗜热菌中提取了高温DNA聚合酶,使得扩增DNA的假想又进步了一步。 PCR手艺发现完成最后一脚射门的弓手是美国生物化学家凯利·穆里斯。据穆里斯回想,1983年4月的一个礼拜五晚上,穆里斯开车往乡间别墅的路上,蓦地闪现出多聚酶链反映(PCR)的设法。1985年,穆里斯在Cetus公司工作时代,成功发现了PCR。 PCR发现后,有人赞誉这一发现将生物学划分为两个时期:PCR前时期和PCR后时期。有了PCR手艺,可以将肆意痕量的DNA份子扩增,利用于各个方面,如诊断疾病、生物个别辨认、亲子判定、刑事鉴识发现罪犯、产前诊断确诊遗传病等。因为发现了PCR,穆里斯取得了1993年的诺贝尔化学奖。 核酸检测法不但用于新冠病毒传染的诊断,也普遍用于其他病毒性传染疾病。2003年“非典”时代,中国研究职员研发出巢式PCR手艺的核酸检测试剂盒,用以诊断病人。尔后,对H7N9禽流感也研发了核酸检测试剂盒。2014年,中国“艾滋病和病毒性肝炎等重年夜沾染病防治”科技重年夜专项获得一系列主要研究功效,此中新型核酸检测手艺一次能对艾滋病、乙型肝炎、丙型肝炎三种病毒同时检测,年夜年夜缩短了检测的窗口期。另外,埃博拉病毒、中东呼吸综合征病毒等病毒检测中,都曾利用核酸检测试剂盒。 为什么有人颠末屡次检测才能查出阳性 此刻,PCR用在新冠病毒传染的诊断上,是经由过程快速扩增新冠病毒的特定基因片断来确认受检者是不是被病毒传染的。今朝经常使用的是操纵逆转录聚合酶链反映(RT-PCR)研发的试剂盒。 虽然RT-PCR试剂盒检测比力靠得住,可是在最起头也有假阴性,即检测不出现实上已被病毒进侵的传染者。呈现核酸检测假阴性的缘由有多方面。一是刚起头研发的试剂盒质量不是很高,但后来颠末改良,这一质量短板获得解决。另外一个缘由是,患者在做前几回检测的时辰,病毒还没有充实传染人体细胞,病毒有一个逐步进进细胞的进程。是以,有的人颠末屡次检测才查出病毒核酸阳性。 中国国度卫健委公布的《新型冠状病毒尝试室检测手艺指南》划定,收集标本的种类里有上呼吸道标本(咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物),下呼吸道标本(深咳痰液、呼吸道抽取物、支气管灌洗液、肺泡灌洗液、肺组织活检标本),血液标本,血清标本,后来又增添了粪便、肛拭子。但在现实操纵中,采纳最多的是咽拭子、鼻拭子之类的上呼吸道标本。 因为新冠病毒凡是呈现在传染肺部深处的组织和细胞,是以下呼吸道标本对检测来讲是最好的,病毒多、最易检测出来。可是,深肺组织样本欠好收集,而病人咳嗽的时辰,一些病毒是可以被带到上呼吸道,并且病毒也能够传染上呼吸道,是以上呼吸道标本(咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物)已成为尺度采样。 核酸检测的进程包罗样本收集、样本处置、核酸提取、进行PCR检测等多个步调,此刻全部均匀检测时候需要2-3个小时。因为它是直接对收集标本中的病毒核酸进行检测,特异性强、敏感度相对较高,是以是当前新冠病毒传染检测的首要手段。 延长浏览 抗体检测和抗原检测也是新冠病毒传染诊断方式 除核酸检测,此刻对新冠病毒传染的诊断也采取另外一种经常使用的体例,即抗体测试法。一般环境下,人被新冠病毒传染后,免疫系统会发生抗体来进犯病毒,是以,检测抗体也是一项靠得住的判定人是不是被病毒传染的体例。不外,因为在病毒传染初期,人体内可能还没有发生抗体,存在检测的窗口期,因此抗体检测法只能作为确诊的弥补诊断手段或利用于堆积性疫情溯源。 抗体检测包罗胶体金法和磁微粒化学发光法,此中胶体金法均匀检测时候为15分钟摆布,磁微粒化学发光法一般需要30-60分钟。 以胶体金法为例,试剂中含有病毒抗原,经由过程抗原检测抗体的存在。机体传染新冠病毒后,病毒的特定卵白会刺激免疫系统引发抗体应对。胶体金法就是要检测出人体是不是有新冠病毒抗体。若是人被新冠病毒传染并在血液中含有抗体,就可以与试剂上的新冠病毒的抗原成份连系,构成抗原抗体复合物,在检测线处堆积为红色反映线,证实是阳性(被传染),反之则是阴性。 别的,诊断是不是被新冠病毒传染,还可以采取抗原检测试剂(盒)。试剂纸或卡上包被有新冠病毒抗体,经由过程抗体检测抗原的存在。新冠病毒的抗原成份首要有N卵白、E卵白和S卵白等,当把取样取得的咽拭子、鼻拭子、痰液、血清、血浆等样本滴进试剂盒时,若是这些样本中有病毒抗原,就会与试剂上的新冠病毒抗体构成抗原抗体复合物,检测线处堆积呈现红线,很快就可以得出成果。此刻,国内一些公司出产的新冠抗原检测试剂已能快速精准辨认德尔塔变异毒株,这是由于该试剂(盒)含有德尔塔的S卵白处的特异转变的基因序列。可是,抗原检测需要更高的敏感性,因为新冠病毒首要加害肺泡等下呼吸道,从鼻咽、口咽等上呼吸道取样,纷歧定能收集到病原体,或取样中所含病毒数目较少。是以,抗原检测和抗体检测一样,都是诊断新冠病毒传染的辅助手段。 不成不知 新冠病毒传染与新冠肺炎不是一回事儿 需要申明的是,确诊新冠病毒传染与确诊新冠肺炎其实不是一回事儿,前者只是病毒传染,后者则是在病毒传染后呈现症状。 今朝确认新冠病毒传染的金尺度仍是核酸检测。同时,抗体检测和抗原检测可以作为弥补证据。 若是要确诊为新冠肺炎,还得加上CT片证据,和临床上呈现的症状,如是不是发烧、咳嗽,呼吸是不是坚苦等来确诊新冠肺炎,并判定是轻症仍是重症,抑或是无症状传染,从而采纳响应的医治和预防办法。 分享让更多人看到 |